Sezonun ikinci yarısında sergiledikleri futbolla TFF 1.lig U-21 takımları arasında dikkat çeken ekiplerin başında yer alan Kırmızı beyazlıların U-21 takımı ligin ikinci yarısında oynadığı 18 karşılaşmada sadece 3 yenilgi alarak 12 galibiyetle ligi tamamladı.

Kırmızı beyazlıların U-21 takımın ligin ikinci yarısında yaptığı çıkışla adeta rakiplerine göz dağı verdi. Özellikle iç sahada oynadığı karşılaşmalarda rakiplerine göz açtırmayan Samsunsporlu U-21'ler ligin ikinci yarısı ile birlikte A takımda yer alan bir çok genç futbolcunun takıma geri dönmesiyle büyük sükse yaptılar.

Samsunspor U-21 takımı 2016-2017 sezonunun ikinci yarısında oynadığı 18 karşılaşmanın 12'sini kazanırken sadece 3 karşılaşmada sahadan yenik ayrıldı. İnanılmaz bir çıkış sergileyen ve rakiplerine adeta gol olup yağan Kırmızı beyazlı U-21'ler Göztepe ve Adanademirspor deplasmanlarında ise rakipleri ile gollü beraberlikler alarak evine döndü.